L’équipe hydro plancton s’occupe de prélever des échantillons d’eau pour étudier l’écosystème pélagique. Ce dernier est défini comme un ensemble d’êtres vivants en interrelation.
Les chercheurs s’intéressent tout d’abord à la biocénose, c'est-à-dire la communauté des êtres-vivants. Ils observent un ensemble d’éléments qui sont caractéristiques d’une flore et d’une faune précise. Ensuite au biotope, le milieu dans lequel vivent ces êtres vivants.
Grâce à l’écosystème, ils ont pu observer une chaîne alimentaire :

Biocénose :
Le plancton est l’ensemble des êtres vivants
de petites tailles voire microscopiques qui vivent dans la partie superficielle
des eaux douces ou marines. Leurs mouvements sont la conséquence des
courants. Le Phytoplancton est constitué de végétaux, alors
que le zooplancton est formé par des animaux.
Les prédateurs sont en haut de la chaîne
alimentaire.
Les Anchois et autres petits poissons pélagiques sont surnommés « fourrage de la mer », en effet ils constituent une nourriture abondantes qui va servir à nourrir d’autres êtres. Ils sont au milieu de la chaîne alimentaire,(la pyramide des biomasse) c'est-à-dire qu’ils sont à la fois proies et prédateurs.
Les chercheurs analysent aussi la nourriture de ce type d’anchois, c'est-à-dire principalement du zooplancton, plus particulièrement le copépode, ainsi que des larves de crustacés et de mollusques.
Un système, appelé CUFES
(Continuous Under Watter Fish Eggs Sampling), effectue un pompage de l’eau
maritime en continue qui permet d’estimer l’abondance
des œufs. Grâce à ce système, ils peuvent évaluer
approximativement le nombre d’anchois qui pourront sûrement atteindre
l’âge adulte.
Biotope :
Les Anchois vivent entre deux eaux c'est-à-dire dans un milieu pélagique sur le plateau continental. L’espèce que nous étudions plus précisément, Engraulis encrasicolus, se trouve dans l’atlantique nord-est (par exemple dans le golfe de Gascogne), au Maroc, dans la mer du Nord et dans la Méditerranée. Cet anchois apprécie aussi les eaux dessalées, on peut également l’observer dans certains fleuves.
Les chercheurs relèvent en continu au cours d’une campagne, la température, la salinité et la fluorimétrie du milieu étudié.